제품특징
Advantages
- 경제적인 비용으로 대량 샘플의 Single-cell transcriptome 분석을 단 하루에 할 수 있는 end-to-end 라이브러리 제작 키트
- 고효율 워크플로우는 높은 감도로 transcript 및 유전자 검출이 가능한 full- length transcript coverage를 제공
- Auto-normalization으로 불필요한 QC 과정을 75% 감소
- 시퀀싱 시 최대 1,152 single cell 샘플 multiplexing 가능
높은 감도로 transcript 검출 및 발현 분석
2pg, 10pg의 total HEK293 RNA 또는 single cell 샘플을 각각 plexWell Rapid Single Cell RNA-Seq Kit, SMART-Seq v4 Ultra Low input RNA Kit(Takara Bio), Smart-seq2 method로 라이브러리 제작하여 Illumina NextSeq 500에서 2 * 75bp로 시퀀싱 한 결과
극소량 샘플로 high-complexity 라이브러리 제작 가능
라이브러리는 각각 2pg, 10pg, 100pg, 1ng의 HEK293 total RNA (RIN > 9.0) 샘플을 plexWell Rapid Single RNA-Seq kit 사용하여 제작됨
극소량의 샘플에서 Transcript 발현과 length 수준에서의 높은 재현성
라이브러리는 2pg의 total HEK293 RNA (RIN >9.0)으로 각각 plexWell Rapid Single Cell RNA Library prep kit, Takara SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA kit 그리고 Smart-seq2로 제작 됨.
* TPM: Read count로 length를 보정한 정규화된 RNA 발현량 값
PBMCs와 같은 까다로운 샘플에서의 고품질 라이브러리 제작 가능
BD FACSAria Fusion cell sorter를 이용해 분리된 CD45+ human PBMCs는 plexWell Rapid Kit(녹색, 96 cells), Smart-seq3(빨간색, 96 cells), Smart-seq2(보라색, 48 cells) 그리고 SMART-Seq Single Cell Kit(파란색, 24 cells, Takara)로 라이브러리 제작 됨. 시퀀싱(2 * 75bp)은 Illumina NextSeq에서 진행됨
Applications
- Single-cell transcriptome sequencing
- Allele-specific expression profiling
- Isoform detection
- SNP and variant profiling across full-length transcripts