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Genomics > NGS Library Prep System

plexWell™ Rapid Single Cell

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제품용도
소량 샘플로 경제적이고 고품질의 Full-length transcriptome library 제작 가능한 kit
브랜드
seqWell
개요
cDNA 합성을 위한 Smart-seq2 방식 및 multiplexing의 한계점을 개선하여 높은 감도로 full-length transcripts 검출과 분석이 가능한 Illumina platform 기반의 single cell-RNA library prep kit

Related Information

제품자료
Brochure

제품특징

 

 


Advantages 

 

경제적인 비용으로 대량 샘플의 Single-cell transcriptome 분석을 단 하루에 할 수 있는 end-to-end 라이브러리 제작 키트

- 고효율 워크플로우는 높은 감도로 transcript 및 유전자 검출이 가능한 full- length transcript coverage를 제공

- Auto-normalization으로 불필요한 QC 과정을 75% 감소

- 시퀀싱 시 최대 1,152 single cell 샘플 multiplexing 가능

 





높은 감도로 transcript 검출 및 발현 분석 

 

 

2pg, 10pg의 total HEK293 RNA 또는 single cell 샘플을 각각 plexWell Rapid Single Cell RNA-Seq Kit, SMART-Seq v4 Ultra Low input RNA Kit(Takara Bio), Smart-seq2 method로 라이브러리 제작하여 Illumina NextSeq 500에서 2 * 75bp로 시퀀싱 한 결과



 

극소량 샘플로 high-complexity 라이브러리 제작 가능  

 


라이브러리는 각각 2pg, 10pg, 100pg, 1ng의 HEK293 total RNA (RIN > 9.0) 샘플을 plexWell Rapid Single RNA-Seq kit 사용하여 제작됨 



 

극소량의 샘플에서 Transcript 발현과 length 수준에서의 높은 재현성 

 


라이브러리는 2pg의 total HEK293 RNA (RIN >9.0)으로 각각 plexWell Rapid Single Cell RNA Library prep kit, Takara SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA kit 그리고 Smart-seq2로 제작 됨.

* TPM: Read count로 length를 보정한 정규화된 RNA 발현량 값

 

 


PBMCs와 같은 까다로운 샘플에서의 고품질 라이브러리 제작 가능 

 


BD FACSAria Fusion cell sorter를 이용해 분리된 CD45+ human PBMCs는 plexWell Rapid Kit(녹색, 96 cells), Smart-seq3(빨간색, 96 cells), Smart-seq2(보라색, 48 cells) 그리고 SMART-Seq Single Cell Kit(파란색, 24 cells, Takara)로 라이브러리 제작 됨. 시퀀싱(2 * 75bp)은 Illumina NextSeq에서 진행됨 


 


Applications 

 

Single-cell transcriptome sequencing

- Allele-specific expression profiling

- Isoform detection

- SNP and variant profiling across full-length transcripts

 


제품사양

Compatible Sequencing Platforms Illumina MiSeq, MiniSeq, NextSeq, HiSeq, and NovaSeq instruments
Starting Material Cells and intact total RNA
Input Amount 1 to 1,000 cells, 2 pg to 10 ng intact total RNA
Transcript coverage Full-length

주문정보

Cat No. 품명 규격 제조사 제품정보 수량 견적문의
PWSCR96 plexWell Rapid Single Cell RNA Library Prep Kit 96 samples seqWell Library prep kit 수량증가수량감소 카트담기 카트담기
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PWSCR-A, -B or -C* plexWell Rapid Single Cell RNA Library Prep Kit 384 samples seqWell Library prep kit 수량증가수량감소 카트담기 카트담기
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